2016年53号公告的预付款能扣除所得税吗

可以报销并在税前列支。
依据：
根据税总公告2016第53号
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三、单用途商业预付卡（以下简称“单用途卡”）业务按照以下规定执行：
（一）单用途卡发卡企业或者售卡企业（以下统称“售卡方”）销售单用途卡，或者接受单用途卡持卡人充值取得的预收资金，不缴纳增值税。售卡方可按照本公告第九条的规定，向购卡人、充值人开具增值税普通发票，不得开具增值税专用发票。
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（三）持卡人使用单用途卡购买货物或服务时，货物或者服务的销售方应按照现行规定缴纳增值税，且不得向持卡人开具增值税发票。
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请参考。