16岁女生与16岁男生发生性关系算是犯罪吗

如果与16岁以下14岁以上女性发生性关系，如果没有违背女方的意志，不构成罪。如果违背妇女意志就构成罪。
《刑法》第二百三十六条 强奸罪
以暴力、胁迫或者其他手段强奸妇女的，处三年以上十年以下有期徒刑。 奸淫不满十四周岁的幼女的，以强奸论，从重处罚。 妇女、奸淫，有下列情形之一的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑：
（一）强奸妇女、奸淫幼女情节恶劣的；
（二）强奸妇女、奸淫幼女多人的；
（三）在公共场所当众强奸妇女的；
（四）二人以上的；
（五）致使被害人重伤、死亡或者造成其他严重后果的。