断绝父子关系协议书是否有效？

根据你的问题解答如下, 不知道你说的是什么父子关系。
如果是继父子关系是可以的，按法律规定，调解达成协议，应当制作调解书，调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。不制作调解书，调解未达成协议或调解书送达前一方反悔的，调解无效。调解无效，应当判决。如法官未按法律规定办，可向院长或上级反映。
养父母与成年养子女关系恶化，无法共同生活的，可以协议解除收养关系。不能达成协议的，可以向。法律未规定必须由继父先提出解除。解除的标准是：关系恶化，无法共同生活。