员工违规停职，公司要发放最低工资，合法吗

一、根据您提供的信息，依据法律规定大致可能可以争取的权益有：停职是公司的内部决定,虽是停职,但劳动关系仍然存在.可不付完全工资,但仍须支付一定的基本生活费用或当地最低工资标准的工资。
二、具体法律依据如下：《劳动法》第四十六条　工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。工资水平在经济发展的基础上逐步提高。国家对工资总量实行宏观调控。《劳动法》第四十七条　用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。《劳动法》第四十八条　国家实行最低工资保障制度。最低工资的具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，抱备案。
三、为使您的上述权益得到有利保障，建议您开始搜集以下证据材料：劳动合同、工资流水、证人证言等。