侵占农民耕地该怎样处理

1、土地被人侵占、发生纠纷，当事人协商不成的，可以请求村民委员会、乡（镇）人民政府等调解解决；
2、可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁；
3、也可以直接向人民法院起诉。
按规定，国家保护集体土地所有者的合法权益，保护承包方的土地承包经营权，任何组织和个人不得侵犯。
4、法律依据：《中华人民共和国农村土地承包法》
第五十一条  因土地承包经营发生纠纷的，双方当事人可以通过协商解决，也可以请求村民委员会、乡(镇)人民政府等调解解决。 当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的，可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，也可以直接向人民法院起诉。