1、无施工许可证已竣工的处理是:采取下达责令改正通知书、停工令、约谈责任主体负责人等方式责令停止施工、限期改正,并处工程合同价款的百分之一以上百分之二以下的罚款。
2、法律依据;《建筑法》
第七条 建筑工程开工前,建设单位应当按照国家有关规定向工程所在地县级以上人民政府建设行政主管部门申请领取施工许可证;但是,国务院建设行政主管部门确定的限额以下的小型工程除外。按照国务院规定的权限和程序批准开工报告的建筑工程,不再领取施工许可证。
第六十四条 违反本法规定,未取得施工许可证或者开工报告未经批准擅自施工的,责令改正,对不符合开工条件的责令停止施工,可以处以罚款。