土地承包纠纷和土地权属争议的主要区别在于:
1、是土地承包纠纷绝大多数为民事纠纷,体现的是民事法律关系特征,而土地权属争议大部分属于行政争议,更多地表现为行政法律关系;
2、是处理和审理土地承包纠纷案件要依照《农村土地承包法》规定的程序和民事诉讼法规定的程序进行,而处理和审理土地权属争议案件,则应依照《土地管理法》和《行政诉讼法》规定的程序进行;
3、是《农村土地承包法》对处理土地承包纠纷没有规定行政处理程序,而《土地管理法》对处理土地权属争议则明确设置了行政处理程序;
4、是按照《解释》的规定,即集体经济组织成员因未实际取得土地承包经营权的应当向有关行政主管部门申请解决,此种情形可能引发行政争议和行政诉讼,但该司法解释对此种争议未规定行政复议程序,而对土地权属争议案件,行政复议法和最高人民法院的相关司法解释则明确规定了行政复议的前置程序。