当然是有影响的。首先就是法人及股东被列入工商部门黑名单,3年内不得注册公司,并且不得做其他公司的股东。根据《企业年度检验办法》的有关规定,分公司不按规定接受年检的应被吊销营业执照,当地工商部门会吊销你公司分支机构的营业执照;又根据《企业法定代表人登记管理条例》的规定,“担任因违法被吊销营业执照的企业的法定代表人,并对该企业违法行为负有个人责任,自该企业被吊销营业执照之日起未逾三年的”不得担任法定代表人,虽然该条例规定的是企业的法定代表人,但各地工商部门做法不一样,有的地区会把被吊销的分公司负责人也作为不得担任法定代表人的范围,因此可能造成你们分公司的负责人在分公司被吊销后的三年内在全国各地都不能当法定代表人。