行政公益诉讼有哪些处理意见

1、人民检察院对行政诉讼案件进行调查后，调查结束后，处理意见包括终结案件;提出检察建议两种。
2、法律依据：《人民检察院公益诉讼办案规则》
第七十三条 调查结束，检察官应当制作《调查终结报告》，区分情况提出以下处理意见：
(一)终结案件;
(二)提出检察建议。
第七十四条 经调查，人民检察院认为存在下列情形之一的，应当作出终结案件决定：
(一)行政机关未违法行使职权或者不作为的;
(二)国家利益或者社会公共利益已经得到有效保护的;
(三)行政机关已经全面采取整改措施依法履行职责的;
(四)其他应当终结案件的情形。
终结案件的，应当报检察长决定，并制作《终结案件决定书》送达行政机关。