市区限速40开60要扣分吗

结论：市区限速40开60要扣分，属于超速百分之五十。
解析：
市区限速40开60要扣分，属于超速百分之五十。机动车在城市道路上超过规定时速百分之五十的，扣6分，当由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，可以并处吊销机动车驾驶证。
法律依据：
《道路交通安全法》第四十二条
机动车上道路行驶，不得超过限速标志标明的最高时速。在没有限速标志的路段，应当保持安全车速。夜间行驶或者在容易发生危险的路段行驶，以及遇有沙尘、冰雹、雨、雪、雾、结冰等气象条件时，应当降低行驶速度。