夫妻要是分居了五六年,那是可以去起诉离婚的。《民法典》里有规定,要是夫妻当中有一方想离婚,既可以让有关组织来调解调解,也能直接向人民法院提起离婚诉讼。要是因为感情不和,分居都已经满两年,并且经过调解还是没效果的话,那就应该准许离婚。
在分居这段时间,他们的婚姻关系其实还在,不过长时间分居很可能会让感情破裂。到起诉离婚的时候,得提供一些能证明分居事实的证据,像分居协议、证人说的话、租房合同之类的。法院在判断是不是准许离婚的时候,会把双方的感情状况、分居的原因之类的因素都综合考虑进去。
总之,分居五六年是符合法定离婚条件的,通过起诉离婚的方式是可以解除婚姻关系的,不过最终到底判不判离,那得由法院根据实际情况来决定。