工程合同案件该由哪个法院管辖

法律分析：
（1）工程合同案件通常按不动产纠纷确定管辖，由工程所在地法院专属管辖，这是由于其本质涉及不动产权益，如此规定可使案件审理与不动产状况衔接，利于法院查明事实。
（2）若合同里有有效的仲裁条款，当事人需向约定的仲裁机构申请仲裁，此时法院无管辖权。
（3）确定管辖法院时，要考虑级别管辖规定，不同标的额和复杂程度的工程合同案件，会由不同级别的法院管辖。

提醒：签订工程合同时应明确仲裁条款或管辖法院约定，遇到纠纷需结合案件标的额和复杂程度准确判断管辖，如有疑问可咨询进一步分析。

（一）若工程合同无仲裁条款，应向工程所在地人民法院起诉，因为工程合同案件一般按不动产纠纷确定管辖，由工程所在地法院专属管辖，这样便于法院结合不动产状况查明事实。
（二）若合同中有有效仲裁条款，应向约定的仲裁机构申请仲裁，这种情况下法院无管辖权。
（三）确定管辖法院时要考虑级别管辖，根据标的额和案件复杂程度，由不同级别的法院管辖。

法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》第三十四条规定，下列案件，由本条规定的人民法院专属管辖：
（一）因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖；
（二）因港口作业中发生纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民法院管辖；
（三）因继承遗产纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。

1.工程合同案件通常按不动产纠纷定管辖，由工程所在地法院专属管辖。因为这类纠纷涉及不动产权益，专属管辖利于查明事实。
2.若合同有有效仲裁条款，当事人要向约定仲裁机构申请仲裁，法院不再管辖。
3.确定管辖法院时，要考虑级别管辖。不同标的额和复杂程度的案件，由不同级别的法院管辖。

结论：
工程合同案件一般由工程所在地法院专属管辖；有有效仲裁条款的应向约定仲裁机构申请仲裁；确定管辖法院时要考虑级别管辖。
法律解析：
根据相关法律，建设工程施工合同纠纷涉及不动产权益，所以通常按不动产纠纷确定管辖，由工程所在地法院专属管辖，这样利于法院结合不动产状况查明案件事实。不过，若合同中存在有效仲裁条款，当事人就应通过仲裁解决纠纷，法院不再管辖。同时，不同标的额和复杂程度的工程合同案件，会依据级别管辖规定由不同级别的法院审理。若你在工程合同案件管辖方面存在疑问，或遇到相关法律问题，可向专业法律人士咨询，以获取准确有效的法律建议。