您好,根据您所述情况,您在农村自建房时虽然经过了村委会的批准,但若自然资源局认为您的房屋占用了耕地并已列入违规用地台账,那么您需要依法处理这一问题。首先,您需要了解自然资源局不予受理的具体法律依据,以及遥感卫星测到的违规用地的具体情况。您可以要求自然资源局提供相关证据和法律依据。其次,如果确实存在违规占用耕地的情况,您需要依法进行整改,比如恢复耕地原状,或者按照法律规定进行土地置换等。最后,如果对自然资源局的决定有异议,您可以通过行政复议或者行政诉讼的方式,要求上级行政机关或法院对自然资源局的决定进行审查。建议您尽快咨询专业律师,获取详细的法律意见和帮助。同时,保持与自然资源局的沟通,寻求合理的解决方案。我是济南的殷德友律师,如果仍有疑问,欢迎追问或一对一咨询。