离婚协议中公司财产要怎样进行分配

（一）对于夫妻一方以个人财产投资设立独资企业
企业收益作为夫妻共同财产，双方可协商分割收益。若另一方参与企业经营管理，企业增值部分也属于共同财产，同样需要进行分割。

（二）对于有限责任公司
夫妻一方是股东另一方不是，双方协商转让部分或全部出资额给非股东配偶时，若过半数股东同意且其他股东放弃优先购买权，该配偶成为公司股东；若过半数股东不同意但愿意按同等价格购买出资额，则对转让出资所得财产分割。

（三）对于合伙企业
夫妻一方是合伙人另一方不是，其他合伙人一致同意，配偶可取得合伙人地位；其他合伙人不同意转让且行使优先受让权，可分割转让所得财产。分配财产要依据法律，遵循自愿、公平原则。

法律依据：
《中华人民共和国民法典》第一千零八十七条规定，离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。