农村厂房占了河流用地该怎么处理

农村厂房占用河流用地是严重违规的事儿，涉及土地管理和水法规，下面说说处理办法。
相关部门会行动起来调查取证。自然资源部门和水行政主管部门会到现场，通过勘查、拍照、测绘等方式收集证据，把厂房占用河流用地这一情况摸清楚，确定是不是违法。
要是确定这厂房占用行为违法，部门就会发责令停止违法行为通知书，让违法者马上停手，别再继续破坏了。按照《中华人民共和国土地管理法》和《中华人民共和国水法》，违法者会被罚款，罚款多少得看实际情况。同时，还会要求违法者在规定时间内拆除违法建筑，把河流用地恢复原样。
如果当事人对处罚决定不满意，能在规定时间内申请行政复议或者去法院提起行政诉讼，用法律手段维护自己权益。不过，在复议或者诉讼的时候，一般情况下处罚决定还是得执行。
要是这违法行为让别人受了损失，受损的人可以要求违法者赔偿，赔偿的范围有直接损失和间接损失。双方可以先商量赔偿的事儿，要是商量不拢，受损的人可以去法院打民事诉讼。
给大家提个醒，在农村搞建设，一定要先了解相关法律法规，别随意占用河流用地。要是遇到类似纠纷，要及时咨询专业法律人士，依法解决问题。