没发现不代表没有，该怎么认定

你提的问题不太清晰，没有明确的方向，所以没办法一下子给出有针对性的认定办法。在法律这个圈子里，不同的情况有不一样的认定方式。
先说证据认定这块。要是有一方说存在某个事实，但眼下又没找到能证明这个事实的证据，可不能就这么轻易认定这个事实不存在。在民事诉讼里，有个“谁主张、谁举证”的原则，就是说主张这个事实存在的那一方，得拿出相应的证据。要是拿不出来，就可能面临对自己不利的结果。而在刑事诉讼中，实行的是疑罪从无原则，要是没证据证明犯罪事实存在，就不能认定犯罪嫌疑人有罪。
再说说侵权责任认定。就算暂时没发现侵权行为造成了实际损失，不过要是有证据显示存在潜在的损害风险，那也有可能认定侵权行为成立。就拿环境污染侵权来说，虽然暂时没看到明显的危害后果，但是有科学依据能证明污染物排放会对环境和人体健康产生潜在威胁，那侵权的一方可能就要担责。
随着社会的发展和新情况的不断出现，法律认定的方法和标准也会有相应的变化。以后在证据的获取和认定上，可能会更多地借助高科技手段，侵权责任的认定也可能会更加注重对潜在风险和长远影响的考量。
你最好把具体问题说清楚，是合同纠纷，还是侵权纠纷，或者涉及刑事犯罪之类的，这样我就能给出更准确的法律建议。