派出所立案并协商后能否再追溯要具体情况具体分析。
一般来说,如果协商达成的协议是合法有效的,并且双方都履行完了,那就不能随便再追究了。这是因为在民事法律里,讲究意思自治,双方达成的协议就跟合同一样,对彼此都有约束作用。像一些轻微的治安案件,双方就赔偿等事儿谈好了,钱也给了,那通常就不能再拿这事儿重复提要求。
不过,有几种特殊情况还是能再追究。要是协议是在欺诈、胁迫或者有重大误解的情况下签的,当事人在知道或者应该知道能撤销协议的理由那天起,在规定时间内可以去法院申请撤销协议,之后再依法追究。要是协议没把该赔的都算上,或者赔的钱太少,根本不够弥补受害人损失,受害人可以就没处理的部分接着要赔偿。另外,如果是涉及刑事犯罪的案子,就算双方私下协商了,要不要追究刑事责任是由国家公权力说了算的。只要符合追诉条件,司法机关还是会依法追究犯罪嫌疑人的刑事责任。