1、公司申请破产但还有债务没还完,一般不能直接注销。按照咱们国家的《企业破产法》,公司一旦进入破产程序,就会有专门的管理人来接管公司财产并进行清算。管理人的工作就是把公司的债权债务理清楚,把破产财产变现并做好分配。
2、在处理债务的时候,是有法定的还钱顺序的。先是要还破产费用和共益债务,接着是职工的工资等债权,然后是所欠的税款,最后才轮到普通破产债权。只有把破产财产全部分配好了,也就是说所有债务都按照法定程序和顺序还完了,或者是破产财产不够还所有债务,经过法定程序把破产程序终结之后,才可以去办理公司注销登记。
3、要是债务还没还清就把公司注销了,那债权人的合法权益可就受损了。债权人可以通过法律手段追究相关责任人的责任,比如说让股东、董事这些人在没还清债务的范围内一起承担还钱的责任。所以,公司破产之后一定要严格按照法定程序,把债务处理好才能合法注销。