重大污染环境罪的立案标准是:
1、致使公私财产损失三十万元以上的;
2、致使森林或者其他林木死亡五十立方米以上,或者幼树死亡二千五百株以上的;
3、致使基本农田、防护林地、特种用途林地五亩以上,其他农用地十亩以上,其它土地二十亩以上基本功能丧失或者遭受永久性破坏的;
4、致使传染病发生、流行或者人员中毒达到《国家突发公共卫生事件应急预案》中突发公共卫生事件分级ⅲ级以上情形,严重危害人体健康的;
5、致使一人以上死亡、三人以上重伤、十人以上轻伤,或者一人以上重伤并且五人以上轻伤的;
6、其他致使公私财产遭受重大损失或者人身伤亡的严重后果的情形。
法律依据为:《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(一)》第六十条。