农村土地纠纷，法院已经认定侵权行为,并且判令停止侵害,为何不判令赔偿?

您好，您可以继续起诉。
一、土地确权纠纷
　　土地确权纠纷，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理；单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起30日内以作出处理决定的人民政府为被告提起行政诉讼。
　　
二、土地侵权纠纷
　　土地侵权纠纷，由当事人协商解决。协商不成的，可由土地行政主管部门进行行政调处。当事人对行政调处不服的，可以以对方当事人为被告提起民事诉讼；当事人也可不经行政调处直接提起民事诉讼。
　　
三、土地行政争议
　　土地行政争议，按一般行政复议及行政诉讼程序处理。