做了违章建筑没拿到工程款

遇到这样的情况确实是有些棘手的。
首要问题是，非法构建的建筑其自身的建造地位并不受到任何法律的庇护。
然而，如果您与项目的委托方签署了明确的工程承包合同，并且在整个施工期间您都没有任何的犯错行为，那么不能及时获得工程价款这种情况可能已经触及到了合同违约的标准。
建议您首先总结清理所有与这个工程项目相关的合同文件、施工记录、以及沟通交流的证据资料等等。
如果在合同中有明确规定关于工程款项支付的条款，您就可以依据这些条款向委托方提出您的合法权益要求。
但是请务必注意，当法院处理这类纠纷案件时，他们极有可能会考虑到建筑物非法建设这一性质对您的诉讼请求所带来的潜在影响。
总的来说，您的权益是否能够得到有效的维护，以及能够在何种程度上得到维护，这主要取决于具体的证据和法律的综合分析判断。