您好，土地承包合同书上只有镇政府的章，没有旗政府章行吗？

协议有效，证明人的签字，在我国法律上并非是奏效要求，只要是两方真实意思表示，无违背法律法规和社会良序风俗的就合法有效。法律依据《合同法》第九条　当事人订立合同，应当具有相应的民事权利本领和民事做法本领。当事人依法能够委托代理人订立合同。
第四十四条　依法成立的合同，自成立时奏效。法律、行政法规限定应当解决准许、登记等手续奏效的，依照其限定。
第六十条　当事人应当按照商定全面履行自己的义务。当事人应当遵循诚实信用原则，根据合同的性质、目的和交易习惯履行通知、协助、保密等义务。第九十三条　当事人商量一致，能够解除合同。当事人能够商定一方解除合同的要求。解除合同的要求成就时，解除权人能够解除合同。第九十四条　有下列情形之一的，当事人能够解除合同：
（一）因不可抗力招致不能实现合同目的；
（二）在履行时限期满之前，当事人一方明确表示或者以自己的做法表明不履行主索债务；
（三）当事人一方迟延履行主索债务，经催告后在合法时限内仍未履行；
（四）当事人一方迟延履行债务或者有其他违约做法招致不能实现合同目的；
（五）法律限定的其他情形。