法院会不会把避孕套作为组织卖淫嫖娼的证据

结论：可以。
解析：
1、避孕套可以作为组织卖淫罪嫖娼的证据。
2、避孕套只是一种物证，以其存在形式证明案件的相关情况。根据证据分类来说，避孕套是一种间接证据，不能直接证明组织卖淫行为的存在，还需要其他证据证实。例如卖淫人员、嫖娼人员及组织卖淫人的供述；相关证人证言等。
3、证据是指能够证明案件事实的材料。刑事诉讼法第四十八条可以用于证明案件事实的材料，都是证据。证据包括：
（一）物证；
（二）书证；
（三）证人证言；
（四）被害人陈述；
（五）犯罪嫌疑人、被告人供述和辩解；
（六）鉴定意见；
（七）勘验、检查、辨认、侦查实验等笔录；
（八）视听资料、电子数据。证据必须经过查证属实，才能作为定案的根据。