增值税发票超额缴纳是全额扣除还是超额扣除

按照规定，小规模纳税人（包括个体工商户）月销售额不超过3万元，或者按季纳税的季销售额不超过9万元，免征增值税。超过标准按照全部销售额和征收率（3%）计算缴纳增值税。这里的销售额既包括开具发票的销售额，也包括没有开具发票的销售额。所以，如果你开具发票的销售额+没有开具发票的销售额超过标准，就必须全额缴纳增值税，不能只就超出部分缴纳增值税的。但是，对于小规模纳税人，缴纳企业所得税，或者个体工商户缴纳个人所得税，是没有起征点的，既只要有有收入，有应纳税所得额（与利润相近），就必须缴纳。但是对于个体工商户，缴纳个人所得税，许多地方按照销售收入核定征收，规定了销售收入超过2万元或者3万元才缴纳。具体应当向当地税务部门咨询。