【法律意见】
1、如果营业执照及相关证件在公司手里,民事上应该没什么大问题。但是根据《企业年度检验办法》的有关规定,分公司不按规定接受年检的应被吊销营业执照,当地工商部门会吊销你公司分支机构的营业执照;又根据《企业法定代表人登记管理条例》的规定,“担任因违法被吊销营业执照的企业的法定代表人,并对该企业违法行为负有个人责任,自该企业被吊销营业执照之日起未逾三年的”不得担任法定代表人,虽然该条例规定的是企业的法定代表人,但各地工商部门做法不一样,有的地区会把被吊销的分公司负责人也作为不得担任法定代表人的范围,因此可能造成你们分公司的负责人在分公司被吊销后的三年内在全国各地都不能当法定代表人。
2、如果营业执照及相关证件不在公司手里,需要防范其他人拿营业执照进行经营活动,如果产生债务或其他民事纠纷,公司会被追究责任。