公司司法鉴定5级伤残，有什么影响，能鉴定吗？

根据你的问题解答如下, 因伤致残原因不同，申请鉴定的程序、鉴定机构、依据的鉴定标准有所不同，造成鉴定结果的伤残等级不一致：
工伤致残的，工伤职工要先向当地人力资源和社会保障局申请工伤认定，领到工伤认定书后向设区的市级劳动能力鉴定委员会申请劳动能力鉴定，依据的是《劳动能力鉴定职工工伤与职业病致残等级》；
交通事故致残的，可以由交警队委托向司法鉴定机构进行伤残等级鉴定，也可以由受害人向后，申请委托鉴定，依据的是《道路交通事故受伤人员伤残评定》；
见：
1、《工伤保险条例》
第二十一条　职工发生工伤，经治疗伤情相对稳定后存在残疾、影响劳动能力的，应当进行劳动能力鉴定。
第二十三条　劳动能力鉴定由用人单位、工伤职工或者其近亲属向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出申请，并提供工伤认定决定和职工工伤医疗的有关资料。

2、《道路交通事故处理程序规定》
第三十七条需要进行检验、鉴定的，公安机关交通管理部门应当自事故现场调查结束之日起三日内委托具备资格的鉴定机构进行检验、鉴定。尸体检验应当在死亡之日起三日内委托。

3、《民事诉讼法》
第七十六条当事人可以就查明事实的专门性问题向人民申请鉴定。当事人申请鉴定的，由双方当事人协商确定具备资格的鉴定人；协商不成的，由人民指定。