发生了医疗纠纷，并不一定都需要通过繁复的法律程序来确定赔偿。有的时候，如果医患双方都实事求是、通情达理，患者或者患者家属与医院可以和平协商解决医疗事故的赔偿及善后事宜。因为协商解决具有很大的灵活性，所以没有墨守成规的具体程序，比如为了明确责任是否需要启动鉴定程序就可以由医患双方协商决定出于方便医院与行政主管部门报告，医患双方也可以先共同委托有鉴定权的医学会做医疗事故技术鉴定，确定是否构成医疗事故、医疗事故的等级及医疗行为对损害后果所起的作用，然后患者与医院协商来确定赔偿数额，也可以不进行鉴定而直接由医患双方协商赔偿数额。
当然，双方当事人协商解决医疗事故赔偿等民事责任争议的，应当制作协议书。协议书应当载明双方当事人的基本情况和医疗事故的原因、双方当事人共同认可的事实以及协商确定的赔偿数额等，至于具体内容，双方可以灵活掌握，并由双方当事人在协议书上签名。
这样一来，有凭有据，白纸黑字，清清楚楚。协商解决这一途径，优点和缺点都极为鲜明：优点在于快速高效，省却了大量繁复的程序，可以节省时间和医患双方的精力，并且尽量不给患方增加新的情感伤害。但这一做法需要医患双方都保持一定的克制和理性，在心平气和的状态下进行，而这正是大多数医疗纠纷的当事人双方所缺少的，尤其是近年来，大量“医闹”事件的发生，激化了医患矛盾，不理性的做法也使得医患双方难以坐下来好好谈。
另外协商解决医疗损害赔偿问题缺少强制力的保障，协商完成后双方当事人都有可能反悔，导致协商结果无法落实，重新走向法律程序，反而更浪费此前的努力。
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