政府采购招标文件中投标保证金的收取金额超过规定的标准该怎么处理

可以向有关部门投诉。

您好，按照规定（1)工程建设项目投标保证金一般不得超过投标总价的2%，但最高不得超过80万元人民币。
(2)勘察设计项目招标文件要求投标人提交投标保证金的，保证金数额一般不超过勘察设计费投标报价的2%，最多不超过10万元人民币。
(3)政府采购项目招标采购单位规定的投标保证金数额，不得超过采购项目概算的1%。
(4)招投标法实施条例（适用于工程建设的施工、勘察、设计、监理、设备采购等）投标保证金不得超过项目估算价的2%。您说的超标是不符合规定的，要进行整改不然是违法建造。