1.补充医疗保险主要是由单位自行办理的,可以按照单位职工的工资总额的4%为计提,税前列支,有单位的会开设专业户进行管理,实行专款专用。根据相关法律规定,企业按照国家 统一为职工缴纳的五险一金的费用,准予扣除,企业为职工支付的补充医疗保险的费用,补充养老保险费用,在国家财务部规定的范围和标准内是可以准予扣除的。企业补充医疗保险的资金是有企业和行业集中使用和管理,主要用于本企业个人负担较重的退休人员和职工的医药费用补助,不得划入基本医疗保险的个人账户中,也不得另行建立个人账户或用于职工其他方面的开支。
2.法律依据:《中华人民共和国基本医疗卫生与健康促进法》 第八十二条 基本医疗服务费用主要由基本医疗保险基金和个人支付。国家依法多渠道筹集基本医疗保险基金,逐步完善基本医疗保险可持续筹资和保障水平调整机制。公民有依法参加基本医疗保险的权利和义务。用人单位和职工按照国家规定缴纳职工基本医疗保险费。城乡居民按照规定缴纳城乡居民基本医疗保险费。