申请了XX的工作，签完合同等待入职期间，考上了研究生，选择去读研，XX的接受新员工协议书里面写了一条，乙方发生违约时，自愿向甲方交纳违约金人民币五千元

乙方实施违约行为时，甲方没有损失的，乙方也是要支付违约金的，只要双方的合同中明确约定了违约金的具体数额或者是比例，但是可以不用支付给甲方损害赔偿金，因为乙方的违约行为没有对甲方造成任何的实际损害，所以不存在赔偿问题。乙方在支付违约金时，应当按照合同中规定的违约金支付方法或者是金额支付。

双方之间的违约金不一定是一致，违约金在原则上不得超过签订合同时所预见的或者是违约可能造成的损失范围。所以双方的违约金应该是按照签订合同时预见违约可能造成的损失而去确定双方各自的违约金，所以双放的违约金不一定是一致的。

甲乙双方违约金可以是一致，也可以有不同，但还是要看双方是如何协商的；违约金是指按照当事人的约定或者法律直接规定，一方当事人违约的，应向另一方支付的金钱。违约金的标准是金钱，但当事人也可以约定违约金的标的物为金钱以外的其他财产。

学生或者员工在规培途中要去进行读研确实违反了相关规定，但是否要赔偿违约金还需要根据具体的情况来进行判断，且违约的金额一般不能超过当事人造成损失的百分之三十，也可以根据情况增加。

我们的衣食住行，因为有了法律规则才能更好的保障我们各自的权益不被侵害，我们的生活是离不开法律的，因此应该提高对法律知识的了解和认识，避免在遇到法律问题无法维护自己的合法权益。也许您现在面临着乙方违约甲方怎么终止合同的问题，希望本篇文章的内容能够帮助到您。