不动产抵押登记在哪个部门办理

依据相关法律法规的规定，不动产抵押登记应由县级以上的地方各级人民政府指定的机构负责办理。具体而言，对于涉及城市房产或乡镇、农村企业所拥有的厂房等建筑物作为抵押物的情况，其抵押登记手续均须在县级以上地方各级人民政府规定的部门进行办理。

解析：
不动产抵押登记的事宜，须按照地级市以上的各级地方人民政府所规定的部门进行处理。依据相关法律法规，以城市房地产或乡村（镇）、农村企业的工厂及其他建筑物作为抵押物申请贷款，均需到地级市以上的各级地方人民政府所规定的部门进行办理。
法律依据：
《民法典》第三百九十四条
为担保债务的履行，债务人或者第三人不转移财产的占有，将该财产抵押给债权人的，债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形，债权人有权就该财产优先受偿。前款规定的债务人或者第三人为抵押人，债权人为抵押权人，提供担保的财产为抵押财产。