首先,你家的果树已经有证,这就表明这果树的产权那是清清楚楚地归你家所有。邻居,没经过你的同意就把果树给砍掉了,这就属于侵权行为。
你可以先去找邻居商量商量,让他把果树恢复成原来的样子,或者给你赔偿损失也行。要是商量不就可以向当地的村委会、居委会之类的基层组织去反映情况,让他们帮忙调解调解。
调解没啥效果,那你就可以到人民法院去提起民事诉讼,要求邻居承担侵权的责任,赔偿你因为果树被砍而遭受的经济损失,这里面包括果树本身的价值以及它可能带来的预期收益等等。
在诉讼的时候,你得准备好相关的证据,像果树的产权证明,还有果树被砍的现场照片之类的,用这些证据来支持你的诉求。总之,你有权利去维护自己的合法权益,通过合法的途径让邻居承担相应的法律责任。