最近公司同事因为工作加班，所以公司安排调休，同事不懂这方面的，托我咨询一下，调休要扣全勤奖吗？算缺勤吗，员工加班后调休是否算全勤

结论：加班调休是全勤,具体要看公司的相关规定。
解析：
加班是要给付加班费的,国家规定加班费标准如下:在法定节假日期间,用人单位安排劳动者工作的,应支付不低于劳动者工资的300%的工资报酬,并不得以调休、补休替代。
法律依据：
《劳动法》第四十四条　
有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。