我是跑车的，货卸完后工地老板不付运费，我该向那个部门讨薪

1、首先根据你的描述，通过“建筑工人”、“老板”、“欠条”、“讨薪”这几个关键字，足以判断，你是在建筑工地打工，年底老板没有给工资给你们工人。所以你们与老板之间属于劳务合同关系而不属于劳动合同关系。
2、劳务关系，合法有效，应当受到相关法律法规的保护；你们都应当按照《合同法》第60条规定诚实信用的履行相应义务；老板拖欠你劳动报酬的行为，显然属于违约行为；
3、根据《建设领域农民工工资支付管理暂行办法》第七条规定：企业应将工资直接发放给农民工本人，严禁发放给“包工头”或其他不具备用工主体资格的组织和个人。同时根据《建设领域农民工工资支付管理暂行办法》十二、工程总承包企业不得将工程违反规定发包、分包给不具备用工主体资格的组织或个人，否则应承担清偿拖欠工资连带责任。
4、只要你们老板是不具承包资质，并且没给你发工资的，你们可以直接去找他上面的具备承包资质的公司索要工资。或者将他们列为共同被告。
5、依据《合同法》第107条规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。所以，你可以要求老板继续履行合同，支付你的工资；
6、若老板具有承包资质，可以直接起诉包工头要求支付工钱，若老板不具有承包资质，你可以将老板和具有承包资质建筑公司列为共同被告，要求其承担连带责任。待判决后，申请强制执行。

老板不付给你运费，你可以向劳动监察大队反映，有劳动监察大队处理。劳动监察大队处理不了的，你可以向法院起诉。退休法官袁长伦律师为你解答。具体事宜有不清楚的，可以当面咨询或者电话沟通。