妹妹现在还是未成年人，还在学校上学，但是他和同学之间发生了互相斗殴的行为，导致妹妹都受到伤害，对方也是未成年人，伤害我妹妹的行为的人会受到怎么样的处罚，学校会有责任吗？

首先，您妹妹属于未成年人，伤害您妹妹的同龄人亦属于未成年人。对于未成年人在校期间自身受到的伤害或者是造成他人人身伤害的，第三人、学校和监护人应承担的责任各自不同的责任。伤害您妹妹的未成年人必然要对您妹妹的损害承担责任，由于限制行为能力人无法对对外独立承担责任，其侵权赔偿责任由其监护人承担。
其次，限制民事行为能力人在学校或者其他教育机构学校、生活期间受到人身损害，学校或者其他教育机构未尽到教育、管理职责的，应当承担责任。这种情况下，校方承担过错责任，即校方存在过错才承担责任。如果您要主张由校方承担部分责任的话，需要您举证证明校方未尽到教育、管理职责的过错。
最后，根据您的案情，您可以主张学校对未成年学生没有充分履行教育、管理和保护的义务，导致学生之间发生了这样的事故，主观上有一定过错，理当成为本案的责任承担主体。