分居已经有三年多了，双方都想要孩子怎么办

一、离婚孩子抚养权归谁孩子抚养是归父母双方的，由谁抚养要看个人能力、孩子的情况等进行判断的。如果双方可以协商一致，可以协商决定孩子由谁抚养，如果不能协商一致，只能由法院进行判决，法院一般根据有利于孩子健康成长的原则进行判决。法律关于法院判决孩子抚养权归属的相关规定：
1、2周岁以下的孩子，一般随母亲生活。如果母亲有以下情形之一的，也可随父方生活：
（1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的；
（2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的；
（3）因其他原因，子女确无法随母方生活的。
2、父母双方协议两周岁以下子女随父方生活，并对子女健康成长无不利影响的，可予准许。
3、对两周岁以上未成年的子女，父方和母方均要求随其生活，一方有下列情形之一的，可予优先考虑：
（1）已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的；
（2）子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利的；
（3）无其他子女，而另一方有其他子女的；
（4）子女随其生活，对子女成长有利，而另一方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或者有其他不利于子女身心健康的情形，不宜与子女共同生活的。另外，父母双方协议两周岁以下子女随父方生活，并对子女健康成长无不利影响的，可予准许。