《民法典》能调整甲公司与其分公司的业务指导关系吗

不受《中华人民共和国民法典》的严格规范。
《民法典》专注于涉及平等地位的行为体之间所开展的各类民事活动之中所产生的人身联系以及财产关联进行调整。
甲公司与其分支机构之间的业务指导关系，该类关系本质上属于同一个主体内部的组织管理关系，而非发生在具有同等地位的行为体之间的民事活动，因此并不涵盖在《民法典》所调整的范围之内。《中华人民共和国民法典》第二条
民法调整平等主体的自然人、法人和非法人组织之间的人身关系和财产关系。