普通增值税发票开取，如果是政府部门没有纳税人识别号，可不可以用机构代码

可以，但必须符合财政部、国家税务总局的有关规定。而且，一般纳税人(含“营改增”试点一般纳税人，特殊情况除外)选择简易办法计算缴纳增值税后，36个月内不得变更。
根据现行规定，一般纳税人可以选择按照简易办法计算缴纳增值税的，主要有以下四种情况形：
(1)一般纳税人销售自产货物;
(2)特定行业一般纳税人销售特定货物;
(3)一般纳税人销售自己使用过的物品;
(4)“营改增”试点一般纳税人的特定应税服务。
简易征收，即简易征税办法，是增值税一般纳税人，因行业的特殊性，无法取得原材料或货物的增值税进项发票，所以按照进销项的方法核算增值税应纳税额后税负过高，因此对特殊的行业采取按照简易征收率征收增值税。