两份合同内容不一致的,法院会根据有效的那份合同进行判决。根据《民法典》第一百四十三条规定,具备下列条件的民事法律行为有效:(一)行为人具有相应的民事行为能力;(二)意思表示真实;(三)不违反法律、行政法规的强制性规定,不违背公序良俗。1、若两份合同均有效,但是签订时间有先后的,且基于同一合同标,同样当事人依法签订的,除当事人有特别约定的,则根据意思最近最新,一般以后签订的合同为准。2、若两份合同签订时间一样,根据双方合同目的及实际履行情况,一般以实际履行的合同为准。 法律依据《民法典》第一百四十三条具备下列条件的民事法律行为有效:(一)行为人具有相应的民事行为能力;(二)意思表示真实;(三)不违反法律、行政法规的强制性规定,不违背公序良俗。