耕地占用税归哪里管

解析：
根据我国法律规定，耕地占用税应由地方税务机构负有主要的征缴职责。土地管理部门在通知相关单位或个人办理耕地占用手续之际，必须同时向耕地所在地区的同级地方税务机构发出通知。经批准占用耕地的单位或个人，须自接到土地管理部门的通知之日起三十个自然日内，依法缴纳耕地占用税。土地管理部门将依据耕地占用税的完税证明或免税证明以及其他相关文件，为获批者颁发建设用地批准证书。
法律依据：
《中华人民共和国耕地占用税法》第四条
耕地占用税的税额如下：
（一）人均耕地不超过一亩的地区（以县、自治县、不设区的市、市辖区为单位，下同），每平方米为十元至五十元；
（二）人均耕地超过一亩但不超过二亩的地区，每平方米为八元至四十元；
（三）人均耕地超过二亩但不超过三亩的地区，每平方米为六元至三十元；
（四）人均耕地超过三亩的地区，每平方米为五元至二十五元。