合同到期未续签两年后才发现如何处理

若双方达成续约协议的合同期满两年以后，劳动者仍继续为用人单位提供服务，这将被视为已签订了无固定期限的劳动合同，并且应从原合同结束之日起，每月向劳动者发放双倍薪酬以作补偿；倘若劳动者在合同终止后便即刻离开了用人单位，那么用人单位则需支付相应的经济补偿金，除非在此期间，用人单位维持或提升了原劳动合同所规定的条件并提出续订劳动合同，而劳动者却拒绝签署新的合同。

解析：
在劳动合同期满两年之后，若劳动者仍继续为该雇主工作，则可被视为双方已签署了无固定期限劳动合同。在这以后，从实际形成无固定期限劳动关系的那一天开始，雇主应每月向劳动者支付双倍工资作为报酬；反之，在劳动合同到期时，如果劳动者已经离开了雇主，那么雇主有义务支付相应的经济补偿金，除非在此期间，雇主维持或提升了原劳动合同所规定的条件并要求续签，而劳动者却拒绝同意。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》第八十二条
用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。
用人单位违反本法规定不与劳动者订立无固定期限劳动合同的，自应当订立无固定期限劳动合同之日起向劳动者每月支付二倍的工资。