40年产权的商铺,在其产权到期后,要依据相关的法律规定来进行处理。通常的情况是会自动续期。也就是说,土地使用者如果还希望继续使用这块土地,那么最迟要在期限届满前一年的时候去申请续期。不过,除非是因为社会公共利益的需要而必须收回这块土地,否则一般都会予以批准。要是获得了批准并且准予续期,那就需要重新签订土地使用权出让合同,然后按照规定缴纳土地使用权出让金。要是土地使用权出让合同约定的使用年限到了,而土地使用者没有申请续期,或者虽然申请了续期却没有按照前面所说的规定获得批准,那么土地使用权就会被国家无偿收回。但对于地上的建筑物以及其他附着物,会根据具体的实际情况来进行处理,一般都会给予相应的补偿。这些具体的事宜都得依据当地的相关法律法规以及政策来执行。