公司只有商业险员工发生工伤怎么办

（一）关于工伤认定
    1. 申请主体和时间要求：公司作为用人单位，应当在规定的时间内，向劳动保障行政部门提出工伤认定申请。一般来说，要在员工发生工伤事故或者被诊断、鉴定为职业病之日起的一定期限内提出申请。要是公司因为各种原因没有按照规定去申请，工伤职工本人或者他的近亲属，还有工会组织也是可以提出工伤认定申请的。
    2. 申请材料准备：申请工伤认定的时候，需要提交劳动合同，这个是证明员工和公司存在劳动关系的重要材料；还需要医疗诊断证明，比如医院出具的病历、诊断书等相关材料。劳动部门在收到申请和材料后，会根据这些材料以及实际调查的情况，来确定员工所受伤害是不是属于工伤。

（二）关于待遇承担
    1. 商业险赔偿方面：商业险的赔偿是依据商业保险合同的条款来进行的。保险公司会根据合同约定，对符合条件的费用进行理赔。不过需要注意的是，商业险的赔偿有可能没办法完全弥补员工因为工伤所遭受的损失。
    2. 公司责任方面：即便公司给员工买了商业险，公司还是要承担工伤保险责任范围内的费用。如果商业险理赔后，没能足额赔偿员工应该享受的工伤待遇，员工是有权利要求公司补足差额部分的。

法律依据：
《工伤保险条例》规定，用人单位应当参加工伤保险而未参加的，由社会保险行政部门责令限期参加，补缴应当缴纳的工伤保险费，并自欠缴之日起，按日加收万分之五的滞纳金；逾期仍不缴纳的，处欠缴数额1倍以上3倍以下的罚款。依照本条例规定应当参加工伤保险而未参加工伤保险的用人单位职工发生工伤的，由该用人单位按照本条例规定的工伤保险待遇项目和标准支付费用。用人单位参加工伤保险并补缴应当缴纳的工伤保险费、滞纳金后，由工伤保险基金和用人单位依照本条例的规定支付新发生的费用。

商业险与工伤保险确属不同险种，公司仅为员工买商业险时，员工工伤后的处理至关重要。

1. 工伤认定方面：公司需按规定时间向劳动保障行政部门申请工伤认定，若未履行此义务，工伤职工、近亲属或工会组织可提出申请。申请时要提交劳动合同、医疗诊断证明等材料，劳动部门会结合材料与调查确定是否工伤。
2. 待遇承担方面：商业险会按合同条款由保险公司理赔，但可能无法弥补全部工伤损失；公司要承担工伤保险责任范围内费用，若赔偿不足，员工有权要求补足差额。

为避免纠纷和法律风险，公司应尽快办理工伤认定，积极担责。员工也要增强维权意识，及时主张自身权益，通过合法途径争取应得待遇。