你好，有个协议效力问题想咨询一下。就同一合作事项，我单位与合作单位拟签署两份书面协议，两份均会加盖双方公章。其中我方出具的协议中约定：配套的对方制式协议仅用于对方内部日常管理备案，内容与本协议不一致的，以本协议为准。对方制式协议为固定模板，不做修改，也不包含任何协议效力相关内容。请问：1.?仅在其中一份协议中约定的效力优先级条款，是否具备法律效力？2.?若两份协议内容出现冲突，司法实践中是否会按该优先级约定执行？

1、一般情况下的约定，在合法的前提下是有法律效力的。
2、两份协议出现冲突，那么要么是主合同和补充合同，如果约定的主要内容相同，以时间较后的合同内容为准。

1. 效力优先级条款具备法律效力。根据《民法典》第五百零五条，合同双方可以约定合同的效力优先级，该约定不违反法律强制性规定，应为有效。2. 若两份协议内容出现冲突，司法实践中一般会按照双方约定的优先级执行。但若对方制式协议中的内容违反法律强制性规定或公序良俗，则该部分内容无效，应以你方出具的协议为准。同时，法院也会考虑双方的真实意思表示和合同履行情况等因素，综合判断。我是济南的殷德友律师，如果仍有疑问，欢迎追问或一对一咨询。

一、仅在一份协议中约定"以本协议为准"是否有效？

原则上有效。 该条款是双方真实意思表示的一部分，只要：

? 两份协议均经双方盖章确认（表明双方对整套文件——含你方协议中的优先级条款——均予以认可）；

? 不违反法律、行政法规的强制性规定（如招投标法关于中标合同实质性内容的强制性规定）。

你方协议中载明"配套对方制式协议仅用于对方内部备案，内容与本协议不一致的以本协议为准"，这一条款经双方盖章即对你方协议本身生效，视为双方共同确认了两份文件的效力位阶。

例外提醒：若你们的合作事项属于依法必须招投标的项目（如大型基建、国有资金工程等），备案的中标合同受《招标投标法》第四十六条保护，即使另行约定"以未备案协议为准"，法院仍可能优先适用中标备案合同，"阴合同"中关于效力优先级的约定在此情形下可能被认定无效。

二、内容冲突时法院是否按该优先级执行？

一般民事合同（非强制招投标）——多数会按你方协议执行：

司法实践普遍尊重当事人意思自治。既然双方共同盖章认可了你方协议中"冲突时以本协议为准、另一份仅作备案"的约定，法院通常会认定这是双方对两份文件关系的合意安排，以你方协议（实质履行协议）为准，另一份仅作备案使用。

若两份协议签署时间不同且无特别约定，无优先级条款时本应按"后签优于先签"或实际履行情况判断，但你方已有明确的优先级约定，应优先适用该约定。

必须招标/中标备案项目——可能不被支持：

若属强制招投标项目，最高法司法解释规定实质性内容不一致的以中标备案合同为准，你方私下约定的优先级条款不能对抗该强制性规则。