第二十八条 因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼,由运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院管辖。
第二十九条 因侵权行为提起的诉讼,由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖。
第三十条 因铁路、公路、水上和航空事故请求损害赔偿提起的诉讼,由事故发生地或者车辆、船舶最先到达地、航空器最先降落地或者被告住所地人民法院管辖。
关于管辖的问题,上面几条已经很清楚了,你可以以合同违约来打官司,也可以打侵权官司,可以管辖的法院很多,但是我觉得最好的是选择一个有利于原告的法院来打嘛。
至于被告嘛,你管他物流公司和车主是什么关系啊?没必要考虑,如果爽快点就直接把物流公司列为被告就行了嘛。
以上是运输合同损害赔偿诉讼地法院的解答。