伯伯跟他的朋友一起开了一家公司，现在他们商议变更公司的股权，由原来的伯伯占60他的朋友占40，变成现在的两人各占50%，但是就是不清楚法律上允许吗，注册公司两个股东各占50%可以吗

可以的。
公司股权比例、持股数额，由各股东协商确定，并记载于公司章程中。公司股权变更的，也是由股东协商持股比例，可以各占50%。法律对此没有限制性规定。
《公司法》规定：
第三十一条　有限责任公司成立后，应当向股东签发出资证明书。
出资证明书应当载明下列事项:
（一）公司名称；
（二）公司成立日期；
（三）公司注册资本；
（四）股东的姓名或者名称、缴纳的出资额和出资日期；
（五）出资证明书的编号和核发日期。