员工旷工按用人单位依法制定的规章制度处罚。
旷工，指无正当理由不请假或者请假不准而不出勤，是严重违纪行为。国务院原《企业职工奖惩条例》第十八条曾经规定：“职工无正当理由经常旷工，经批评教育无效，连续旷工时间超过15天，或者一年以内累计旷工时间超过30天的，企业有权予以除名”。计划经济时期，一些地方劳动部门也曾经规定，旷一扣二，即旷工一天，扣工资一天，另处罚一天。但这些规定均已废止。按《劳动法》规定，旷工如何处罚，由用人单位依法制定的规章制度规定。
旷工扣工资，旷一扣二，还是旷一扣三，超过当天的部分都是对职工的经济处罚。目前，对企业有无对职工罚款权，实践中是由争议的。一部分人仍未《企业职工奖惩条例》废止，企业罚款权没有了法律依据，企业不能对职工进行罚款；另一部分人认为，《劳动法》赋予了用人单位依法制定规章制度管理的权利，按《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释》（法释〔2001〕14号）规定，用人单位通过民主程序制定的规章制度，经过公示的，规定了对旷工处罚的，应当有效。
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