单位协议纠纷怎么办

协商、调解、仲裁、诉讼。
针对协议纠纷，解决问题可以通过以下方式进行：
1、协商解决；
2、通过第三者调解解决;
3、申请仲裁：不愿通过协商、调解解决或者协商、调解不成的，可以按照协议约定的仲裁条款或者事后达成的书面仲裁协议，向仲裁机构申请仲裁。
4、诉讼途径解决：协议中未订立仲裁条款，事后又没有达成书面仲裁协议的，可以向人民法院起诉。
法律依据：
《人民调解法》第二条
本法所称人民调解，是指人民调解委员会通过说服、疏导等方法，促使当事人在平等协商基础上自愿达成调解协议，解决民间纠纷的活动。
《中华人民共和国仲裁法》第二条
平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。
《民事诉讼法》第三条
人民法院受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼，适用本法的规定。