公司员工加班要扣除吃饭时间合理吗

关于贵司对于员工加班需扣除用餐时间一事，我认为这是完全合理的。
首先我们需要明确的是，当员工在工作日或者休息日进行额外工作时，他们的雇主理应按照法律规定全额支付相应的加班费用给到这些辛勤付出的员工。
然而在此过程中，我们必须明白一点，那就是员工在进餐期间实际上并未提供任何形式的劳动贡献，因此他们的用餐时间并不在此薪酬范围内，对此雇主是无需承担任何补偿义务的。《劳动法》第四十四条
有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。