最近公司组织员工们进行了一次体格的检查，没有想到的是他居然被查出来得了乙肝，后来公司的领导过来找他并且要求他辞职，咨询一下公司能辞退乙肝员工吗

不能，
一、根据《就业促进法》第三十条　用人单位招用人员，不得以是传染病病原携带者为由拒绝录用。
二、另，依据劳动和社会保障部 、卫生部2007年5月18日颁布的《关于维护乙肝表面抗原携带者就业权利的意见》：
二、促进乙肝表面抗原携带者实现公平就业 (一)保护乙肝表面抗原携带者的就业权利。除国家法律、行政法规和卫生部规定禁止从事的易使乙肝扩散的工作外，用人单位不得以劳动者携带乙肝表面抗原为理由拒绝招用或者辞退乙肝表面抗原携带者。
因此，用人单位以患乙肝为由与劳动者解除劳动合同是违反法律规定，并要根据《劳动合同法》第八十七条　用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。